Die Funktionen des Körpers und die Funktionsfähigkeit des Individuums in seinem alltäglichen Leben sollen wiederhergestellt, verbessert oder erhalten werden (gemäss der Internationalen Klassifikation der Funktionsfähigkeit, Behinderung und Gesundheit ICF der Weltgesundheitsorganisation WHO). Diese Ziele werden bei Krankheit, nach Unfällen und bei Behinderungen verfolgt.

Das Einwirken auf Schmerz steht oft im Vordergrund. Bei chronischen Zuständen geht es häufig darum, ein Verhalten zu verändern. Die Physiotherapeutinnen unterstützen die PatientInnen und KlientInnen dabei, Strategien zu erlernen für den Umgang mit Krankheits- und Unfallfolgen.

Bei einer bestehenden Erkrankung oder Behinderung sollen negative Folgen vermieden werden: z.B. bei Osteoporose Knochenbrüche, bei Diabetes Durchblutungsstörungen, bei Rückenproblemen Rückenschmerzen. Mit Risikogruppen wird vorbeugend gearbeitet: bei Hochbetagten wird die Kraft trainiert, damit sie z.B. selbstständig aufstehen können, im Wochenbett wird z.B. Beckenbodengymnastik betrieben, um eine mögliche, spätere Inkontinenz zu verhindern.

Die Gesundheit des Individuums und von Bevölkerungsgruppen soll gefördert werden (z.B. Bewegungsförderung bei Schulkindern, betriebliche Gesundheitsförderung, ergonomische Arbeitsplatz-Beratung, Sturzprophylaxe).