Les délégués ont adopté un code professionnel, le Règlement professionnel. Il définit les règles de comportement des membres de physioswiss. Il est obligatoire pour chacun des membres de physioswiss. Pour assurer le respect de ce code professionnel, chaque Association cantonale forme une Commission bleue. Celle-ci qui examine les infractions commises par les membres contre le code professionnel. Les décisions de la Commission bleue peuvent faire l’objet d’un appel à la Commission de déontologie du Comite central.
La Commission de déontologie est constituée de 5 membres nommées par l’Assemblée des délégués.
La Commission de déontologie traite les affaires courantes et forme les membres des Commissions bleues à l’usage du règlement professionnel.